內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學總共有80個專業(yè)。

內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學本科專業(yè)有79個：軟件工程（英漢雙語授課）、食品科學與工程、材料科學與工程、包裝工程、機械設(shè)計制造及其自動化、食品質(zhì)量與安全、計算機科學與技術(shù)（英漢雙語授課）、生物工程、工業(yè)設(shè)計、農(nóng)業(yè)電氣化與自動化、農(nóng)業(yè)機械化及其自動化、電氣工程及其自動化、測繪工程、木材科學與工程（含家具設(shè)計方向、木結(jié)構(gòu)建筑方向）、水利類(英漢雙語授課)、土木工程、交通工程、網(wǎng)絡(luò)工程（英漢雙語授課）、水文與水資源工程、森林工程（公路工程機械方向）、農(nóng)業(yè)水利工程、環(huán)境工程、交通運輸、制藥工程、新能源科學與工程、水土保持與荒漠化防治、草業(yè)科學（含草坪和藥用植物方向，英漢雙語授課）、農(nóng)林經(jīng)濟管理（含畜牧業(yè)經(jīng)濟方向）、化學工程與工藝、動物藥學、服裝設(shè)計與工程、電子科學與技術(shù)、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、園藝（含觀賞園藝方向，英漢雙語授課）、植物保護（含植物檢疫方向）、園林、金融學(英漢雙語授課)、消防工程、行政管理（農(nóng)村發(fā)展與管理方向）、動物醫(yī)學（馬獸醫(yī)方向）、建筑學、物流管理、經(jīng)濟學（貿(mào)易經(jīng)濟方向）、道路橋梁與渡河工程、園林(雙語教學試點班)、動物醫(yī)學（國家第二類特色專業(yè)）、信息管理與信息系統(tǒng)、會計學、動物醫(yī)學、動物科學（動物營養(yǎng)方向，英漢雙語授課）、人文地理與城鄉(xiāng)規(guī)劃、工商管理、水產(chǎn)養(yǎng)殖學、法學、植物科學與技術(shù)、動物科學、法學（英漢雙語授課）、動物生產(chǎn)類（教改試點專業(yè)）、電子商務(wù)、水利水電工程、動植物檢疫（動物方向）、社會工作、地質(zhì)工程、種子科學與工程、生物科學（含英漢雙語授課）、農(nóng)學（含英漢雙語授課）、設(shè)施農(nóng)業(yè)科學與工程、行政管理、車輛工程（英漢雙語授課）、應用化學、土地資源管理、給排水科學與工程、林學、生物技術(shù)（含英漢雙語授課）、應用統(tǒng)計學、英語、森林保護、城鄉(xiāng)規(guī)劃、設(shè)計學類（含環(huán)視覺傳達設(shè)計，環(huán)境設(shè)計，產(chǎn)品設(shè)計專業(yè)）。

內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學其他專業(yè)有1個：運動馬馴養(yǎng)與管理。