解放軍第二炮兵工程大學總共有18個專業(yè)。

解放軍第二炮兵工程大學本科專業(yè)有18個：電子工程、機械工程及自動化、飛行器動力工程、核技術(shù)與安全、雷達工程、管理工程、工程物理、環(huán)境工程、導(dǎo)彈工程、武器系統(tǒng)與發(fā)射工程、火力指揮與控制工程、信息工程、測控工程、指揮信息系統(tǒng)、指揮自動化工程、電力工程及其自動化、通信工程、信息安全。