閩南理工學院總共有17個專業(yè)。

閩南理工學院本科專業(yè)有9個：電子信息工程、國際經(jīng)濟與貿(mào)易、經(jīng)濟學、財務管理、信息管理與信息系統(tǒng)、信息與計算科學、測控技術(shù)與儀器、機械設(shè)計制造及其自動化、電氣工程及其自動化。

閩南理工學院其他專業(yè)有8個：工程管理、服裝設(shè)計與工程、土木工程、人力資源管理、材料成型及控制工程、通信工程、建筑環(huán)境與設(shè)備工程、光電信息工程。