新疆農業(yè)職業(yè)技術學院總共有49個專業(yè)。

新疆農業(yè)職業(yè)技術學院?？茖I(yè)有49個：食品營養(yǎng)與檢測、農畜特產品加工、食品機械與管理、食品加工技術、會計（國際方向）、會計與審計、會計與審計(納稅籌劃)、營銷與策劃、連鎖經營管理、物流管理、物聯(lián)網應用技術、會展策劃與管理、設施農業(yè)技術、會計與審計（中馬合作辦學）、生物技術及應用、農產品質量檢測、廣告設計與制作（藝術類專業(yè)）、旅游英語、種子生產與經營、生物制藥技術、電腦藝術設計（藝術類專業(yè)）、商務英語、計算機應用技術、商務管理（中亞貿易方向）、畜牧獸醫(yī)、藥品質量檢測技術、動物防疫與檢疫、建筑工程技術、信息安全技術、環(huán)境工程技術、獸醫(yī)（動物醫(yī)學）、工程造價、計算機網絡技術、獸醫(yī)（寵物保?。⒊鞘袡z測與工程技術、園林工程技術、軟件技術、畜牧獸醫(yī)（現代馬產業(yè)技術）、計算機信息管理、機電一體化技術、水利工程、動漫設計與制作、園藝技術、汽車檢測與維修技術、酒店管理（中馬合作辦學）、植物保護、農業(yè)機械應用技術、酒店管理、涉外旅游。